河南大学学报(医学版)

2017, v.36;No.132(02) 123-128

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应用R语言MetaOmics分析流程实现基因芯片数据的Meta分析
Application Meta Analysis of Microarray Studies Using the R pipeline MetaOmics

刘小平;李晓东;郭娇;曹越;尹晓红;刘新灿;

摘要(Abstract):

随着基因芯片技术的发展和检测成本的下降,近年来成千上万的基因表达谱研究被公开发表,因此基于基因表达芯片数据的Meta分析对于进一步验证具有重要意义。美国匹兹堡大学研究人员开发的基于R语言的MetaOmics分析流程目前包含的MetaQC、MetaDE和MetaPath程序包,可分别用于基因芯片数据Meta分析质量控制、差异基因筛选以及后续功能分析。本文以9例前列腺癌基因表达谱研究为例,介绍通过MetaOmics基因芯片数据实现Meta分析的具体步骤,为其临床应用提供参考。

关键词(KeyWords): Meta分析;;基因芯片数据;;MetaOmcis分析流程;;R语言

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 河南省中西医结合心血管疑难危急重症创新团队项目

作者(Author): 刘小平;李晓东;郭娇;曹越;尹晓红;刘新灿;

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